nakasone

中曽根　祐介

【プロフィール】
学年：　博士研究員
出身 ： 千葉
AB型, おひつじ座（３月26日）
E-mail： nakasone at kuchem.kyoto-u.ac.jp


【研究テーマ】
青色光センサー蛋白質に共通するドメインの光誘起反応分子機構の解 明

【研究業績】
★発表論文★
1) Takeshi Eitoku, Yusuke Nakasone, Daisuke Matsuoka, Satoru Tokutomi, Masahide Terazima
Conformational dynamics of phototropin2 LOV2 domain with the linker upon photoexcitation
『JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY』, 127 (38): pp 13238-13244, 2005

2) Yusuke Nakasone, Takeshi Eitoku, Daisuke Matsuoka, Satoru Tokutomi, Masahide Terazima
Kinetic measurement of transient dimerization and dissociation reactions of Arabidopsis phototropin1 LOV2 domain
『BIOPHYSICAL JOURNAL』, 91(2):pp 645-53, 2006

3) Yusuke Nakasone, Takeshi Eitoku, Daisuke Matsuoka, Satoru Tokutomi, Masahide Terazima
Dynamics of Conformational changes of Arabidopsis Phototropin1 LOV2 with the Linker Domain
『JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY』, 367(2):pp.432-42, 2007

4) Yusuke Nakasone, Taka-aki Ono, Asako Ishii, Shinji Masuda, Masahide Terazima
Transient dimerization and conformational change of a BLUF protein: YcgF
『JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY』,129(22):pp.7028-35. 2007.

5) Takeshi Eitoku, Yusuke Nakasone, Kazunori Zikihara, Daisuke Matsuoka, Satoru Tokutomi, Masahide Terazima
Photochemical Intermediates of Arabidopsis Phototropin 2 LOV Domains Associated with Conformational Changes
『JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY』, 371(5):pp.1290-303. 2007

6) Yusuke Nakasone, Takeshi Eitoku, Zikihara Kazunori, Daisuke Matsuoka, Satoru Tokutomi, Masahide Terazima
Stability of Dimer and Domain-Domain Interaction of Arabidopsis Phototropin 1 LOV2
『JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY』, 383 (4):pp.904-913. 2008

7) Tanaka K, Nakasone Y, Okajima K, Ikeuchi M, Tokutomi S, Terazima M.
Oligomeric-state-dependent conformational change of the BLUF protein TePixD (Tll0078).
『J Mol Biol. 2009. 386(5):1290-300.』 2009

8) Nakasone Y, Ono TA, Ishii A, Masuda S, Terazima M.　
Temperature-sensitive reaction of a photosensor protein YcgF: possibility of a role of temperature sensor.
『Biochemistry. 2010. 49(10):2288-96.』 2010

9) Kawaguchi Y, Nakasone Y, Zikihara K, Tokutomi S, Terazima M.　
When is the helix conformation restored after the reverse reaction of phototropin?
『J Am Chem Soc. 2010. 132(26):8838-9.』 2010

10) Nakasone Y, Zikihara K, Tokutomi S, Terazima M.　
Kinetics of conformational changes of the FKF1-LOV domain upon photoexcitation.
『Biophys J. 2010. 99(11):3831-9.』 2010

11) Tanaka K, Nakasone Y, Okajima K, Ikeuchi M, Tokutomi S, Terazima M.　　
A way to sense light intensity: Multiple-excitation of the BLUF photoreceptor TePixD suppresses conformational change.　
『FEBS Lett. 2011. 585(5):786-90.』 2011

12) Nakasone Y, Hellingwerf K. J.　　
On the Binding of BODIPY-GTP by the Photosensory Protein YtvA from the Common Soil Bacterium Bacillus subtilis.　
『Photochem Photobiol. 2011. 87(3):542-7.』 2011

13) Tanaka K, Nakasone Y, Okajima K, Ikeuchi M, Tokutomi S, Terazima M.　　
Light-Induced Conformational Change and Transient Dissociation Reaction of the BLUF Photoreceptor Synechocystis PixD (Slr1694).　　
『J. Mol. Biol. 2011. In press (Accepted in April, 2011)』 　 2011

★学会発表★
招待講演
1) "A new time-resolved technique to detect conformation and intermolecular interaction of photosensor protein reactions"
『第８9回日本化学会春期年会Asian international symposium -Organic photochemistry-』, 3F5-13, (March, 2009)

2) “Spectrally-silent reaction dynamics of blue light sensor proteins and their functional importance”
『The Dutch Photoreceptor meeting 2009』 (September, 2009)

国際会議における発表
1) Structual Dynamics of Phot2-LOV2 Domain from Arabidopsis studied by Transient Grating method
『58th Yamada Conference』、Okazaki. Japan (June 2004)

2) Conformational dynamics of phototropin1-LOV2 domain with the linker part upon photoexcitation
『Pacifichem 2005』, 1333, Hawaii. USA (December 2005)

3) Photo-induced structural change of BLUF protein YcgF
『XXIst IUPAC Symposium of Photochemistry』, P009, Kyoto. Japan (April 2006)

4) Equilibrium between monomer and dimer forms of phototropin1-LOV2 domain
『EABS＆BSJ 2006』, 1P440, Okinawa. Japan (November 2006)

5) Equilibrium between monomer and dimer forms of photosensor protein phototropin1-LOV2 domain
『2007 KAIST-Kyoto University Chemistry Symposium』, #14, Kyoto. Japan (January 2007)

6) Direct time-resolved measurement of the thermodynamical properties of photoreceptor protein “phototropin”
『Gordon research conference “Photoacoustic & photothermal phenomena”, 23, Ventura, USA  (February 2008)

7) Biological relevance of photochemistry of LOV protein YtvA
『The annual Dutch meeting on Molecular and Cellular Biophysics 2010』, Eindhoven, The Netherlands, (October 2009)

8) The biological relevance of photochemical parameters and microscopic rate constants of the light-sensor protein YtvA from Bacillus subtilis
『5th Netherlands Institute for Systems Biology (NISB) symposium』,Veldhoben, (October, 2009)

9) The biological relevance of photochemical parameters and microscopic rate constants of the light-sensor protein YtvA from Bacillus subtilis
『Netherlands Consortium for Systems Biology (NCSB) Kick-Off symposium』,(October 2009)

10) The biological relevance of photochemical reaction of LOV protein YtvA and its NTP binding ability
『The annual Dutch meeting on Molecular and Cellular Biophysics 2011』, (October 2010)

国内学会・シンポジウム等における発表
１）過渡回折格子法で見たPhototropin-LOV2ドメイン周りの光反応構造変化ダイナミ クス
 『2004年光化学討論会』、1P097、筑波、2004年11月

２）光誘起拡散係数変化より見たフォトトロピンの構造変化
 『2005年光化学討論会』、1D03、福岡、2005年9月

３）青色光受容体フォトトロピン１LOV2ドメインの光誘起構造変化
 『日本化学会第86回春期年会』、1G4-37、千葉、2006年3月

４）青色光センサー蛋白質フォトトロピンのドメイン間相互作用変化
 『分子構造討論会2006』、2A12、静岡、2006年9月

５）青色光センサーBLUF蛋白質（YcgF）の光誘起二量体形成反応
 『2006年光化学討論会』、3P061, 仙台、2006年9月
 
６）Kinetic measurement of photoinduced dimerization process of BLUF protein YcgF
『第４回「水と生体分子」公開ワークショップ』、P067、京都、2006年12月

７）青色光受容ドメイン(LOV1・LOV2)の光誘起反応分子機構
 『日本化学会第87回春期年会』、4K1-32、大阪、2007年3月

８）BLUF蛋白質YcgFの光誘起反応分子機構
 『第34回生体分子科学討論会』、23、仙台、2007年6月

９）青色光センサー蛋白質フォトトロピンの光反応分子機構とその熱力学的ダイナミ クス
 『第１回分子科学討論会2007』、1C13、仙台、2007年9月

１０）青色光センサーBLUF蛋白質の情報伝達のための光反応
 『2007年光化学討論会』、1P022, 松本, 2007年9月

１１） BLUFタンパク質における光誘起分子内・分子間相互作用変化
『第45回生物物理学会年会』、3P247, 横浜, 2007年12月

１２） The photo-induced change of inter/intra molecular interaction of BLUF protein
『第５回「水と生体分子」公開ワークショップ』、P73、奈良、2008年1月

１３） 青色光センサー蛋白質フォトトロピンの温度依存的光反応
『第８８回日本化学会春期年会』、4C5-39、東京、2008年3月

１４）青色光センサーBLUF 蛋白質の光反応からみた情報伝達機構
『第8回日本蛋白質科学学会年会』、2P-066、東京、2008年6月

１５）BLUF蛋白質YcgFの温度依存的反応分子機構 −温度センサーとしての可能性−
『第35回生体分子科学討論会』、１４、相生、2008年6月

１６）青色光センサーBLUF 蛋白質YcgF の温度依存的会合とその光反応
 『2008年光化学討論会』、1C12, 大阪, 2008年9月

１７）青色光受容蛋白質フォトトロピンの分子論的反応からみた温度センサーとしての可能性
 『第２回分子科学討論会2008』、3P54、福岡、2008年9月(→写真)

１８） Photo-induced reaction dynamics of LOV domains from Arabidopsis
『第46回生物物理学会年会』、2P-277, 福岡, 2008年12月

１９） 植物由来の青色光センサーLOVドメインの光反応とその多様性
『第８９回日本化学会春季年会』、2J1-32, 千葉, 2009年3月

２０） バクテリア由来のLOV蛋白質YtvAの光反応とその生理的意味
『第90回日本化学会春季年会』、大阪、2010年3月

★職歴・賞歴★
2007年度より２年間、日本学術振興会特別研究員（DC2）として採択
2009年度より２年間、日本学術振興会海外特別研究員として採択（アムステルダム大学）
2007年第１回分子科学討論会にて優秀講演賞を受賞 (→写真)
2007年光化学討論会にて最優秀学生発表賞を受賞 (→写真)
2008年第88会化学会春季年会にて優秀学生講演賞を受賞（→写真）
2008年第8回日本蛋白質科学会年会にてポスター賞を受賞(→写真)
2008年第2回分子科学討論会にて優秀ポスター賞を受賞（→写真準備中）

コメント：お酒控えて研究がんばります！寺嶋先生愛してます☆